Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mesp2O08574 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mesp2O08574 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms