Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8356J3QPD3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm8356J3QPD3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8356J3QPD3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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