Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21738J3QP72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21738J3QP72 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21738J3QP72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms