Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17577J3QNF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17577J3QNF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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