Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r58G3X9U3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vmn1r58G3X9U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms