Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5830473C10RikF8VQ07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5830473C10RikF8VQ07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5830473C10RikF8VQ07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms