Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
BicraF8VPZ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
BicraF8VPZ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.31
BicraF8VPZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
BicraF8VPZ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
BicraF8VPZ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
BicraF8VPZ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BicraF8VPZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
BicraF8VPZ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms