Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ercc6F8VPZ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Ercc6F8VPZ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Ercc6F8VPZ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ercc6F8VPZ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ercc6F8VPZ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ercc6F8VPZ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms