Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4aF8VPX6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4aF8VPX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4aF8VPX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Speer4aF8VPX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4aF8VPX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4aF8VPX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms