Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28038F7BCN9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28038F7BCN9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28038F7BCN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28038F7BCN9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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