Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf6F6VAN0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf6F6VAN0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atf6F6VAN0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf6F6VAN0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms