Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf212F6TQD1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf212F6TQD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf212F6TQD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms