Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TrdnE9Q9K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrdnE9Q9K5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrdnE9Q9K5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms