Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna1iE9Q7P2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1iE9Q7P2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms