Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20518E9Q548 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20518E9Q548 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20518E9Q548 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms