Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc144bE9PVZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc144bE9PVZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms