Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim5E9PV98 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim5E9PV98 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim5E9PV98 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms