Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
4930407I10RikD3Z5T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
4930407I10RikD3Z5T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
4930407I10RikD3Z5T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
4930407I10RikD3Z5T8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
4930407I10RikD3Z5T8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
4930407I10RikD3Z5T8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms