Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5930D3Z257 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5930D3Z257 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5930D3Z257 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5930D3Z257 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms