Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif28pD3YXS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kif28pD3YXS5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif28pD3YXS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif28pD3YXS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms