Protein–RNA interactions for Protein: B9EKX1

Ptchd4, Patched domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 904 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd4B9EKX1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptchd4B9EKX1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptchd4B9EKX1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptchd4B9EKX1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptchd4B9EKX1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptchd4B9EKX1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptchd4B9EKX1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptchd4B9EKX1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptchd4B9EKX1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptchd4B9EKX1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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