Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprz1B9EKR1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptprz1B9EKR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptprz1B9EKR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptprz1B9EKR1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms