Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms