Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd34aB2RW11 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34aB2RW11 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34aB2RW11 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd34aB2RW11 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34aB2RW11 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms