Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apba1B2RUJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apba1B2RUJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms