Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf3B2KF05 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf3B2KF05 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brpf3B2KF05 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms