Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Scn7aB1AYL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Scn7aB1AYL1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Scn7aB1AYL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Scn7aB1AYL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scn7aB1AYL1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms