Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap3aB1AWZ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms