Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trabd2bB1ATG9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trabd2bB1ATG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trabd2bB1ATG9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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