Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm438B1ASB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm438B1ASB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm438B1ASB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms