Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prr29B1ARI9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prr29B1ARI9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr29B1ARI9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr29B1ARI9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr29B1ARI9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms