Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5b1A9Z1V5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5b1A9Z1V5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b1A9Z1V5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa5b1A9Z1V5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa5b1A9Z1V5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms