Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp11A9YVJ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp11A9YVJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp11A9YVJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms