Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Herc3A6H6S0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc3A6H6S0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Herc3A6H6S0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herc3A6H6S0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms