Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FocadA2AKG8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FocadA2AKG8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
FocadA2AKG8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FocadA2AKG8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms