Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc4a11A2AJN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc4a11A2AJN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a11A2AJN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a11A2AJN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a11A2AJN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms