Protein–RNA interactions for Protein: A2A8N0

Gm13084, Predicted gene 13084, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13084A2A8N0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13084A2A8N0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm13084A2A8N0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm13084A2A8N0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm13084A2A8N0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms