Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pramef6A2A8M8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pramef6A2A8M8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef6A2A8M8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pramef6A2A8M8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms