Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl2cA2A6C4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sppl2cA2A6C4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl2cA2A6C4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms