Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCD0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCD0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A286YCD0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A286YCD0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A286YCD0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YCD0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms