Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.2 ms