Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1159.8 ms