Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb3P09026 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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