Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms