Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms