Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afb2S4R1M3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afb2S4R1M3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afb2S4R1M3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afb2S4R1M3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms