Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt27Q9Z320 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt27Q9Z320 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt27Q9Z320 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms