Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ybx2Q9Z2C8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ybx2Q9Z2C8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx2Q9Z2C8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ybx2Q9Z2C8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx2Q9Z2C8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms