Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1Q9Z179 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1Q9Z179 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shcbp1Q9Z179 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shcbp1Q9Z179 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shcbp1Q9Z179 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms