Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H3

Smarcb1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcb1Q9Z0H3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcb1Q9Z0H3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcb1Q9Z0H3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcb1Q9Z0H3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcb1Q9Z0H3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcb1Q9Z0H3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms